The UC Davis Genome Center was fortunate to receive a few MinIONs from Oxford Nanopore the other week:

One of the things that we have been trying to do with these wondrous machines is to study variation in a mixed pan-European population. For this study, we simply combined saliva samples from individuals that represent 32 distinct European ethnicities (but no Belgiums, obviously), and the combined sample was applied directly to the MinION using the WF10 setting (WF = warp factor).

The preliminary results look very promising with an N50 read length of 12.2 Kbp (and this was before applying N50 Booster!!!). Here is the very first read from the device...18,731 bp of pan-European goodness (though note that there was a problem with base quality at the end of the read...contamination with Belgium DNA maybe?).

>PanEuroMix_read00001

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